Рособрнадзор включил ВГМУ им. Н.Н. Бурденко в реестр вузов низкого риска. Университет не имеет индикаторов риска нарушений законодательства в образовательной деятельности, имеет хорошие результаты мониторинга системы образования, государственного аккредитационного мониторинга и иных контрольно-надзорных мероприятий. 

По заключению Рособрнадзора, ВГМУ им. Н.Н. Бурденко не подлежит плановым контрольным (надзорным) мероприятиям и обязательным профилактическим визитам.